Простейшая задача: при помощи таймера отсчитать задержку N микросекунд и выставить прерывание. Пол дня чтения мануала и гугля не дали результата. Все найденные примеры работают в цикле (проверил). Попытался запускать таймер однократно, а в обработчике прерывания - останавливать. После этого записываю новое значение задержки в прескаллер и снова запускаю таймер. Результат - желаемая задержка происходит не в текущем цикле таймера, а только в следующем. Мануал гласит, что регистры обновляются по событию переполнения таймера. Подскажите решение.

Совет - сперва включить таймер, поставить значение для срабатывания, настроить прескалер, а потом разрешить счёт таймеру.

Сгенерировать событие переполнения таймера вручную:

Так пробовал, но при этом генерируется прерывание. Пришлось запретить прерывание, обновить регистры, очистить регистр статуса, разрешить прерывание... Криво как то, но заработало. Задержка при этом увеличилась по сравнению с циклическим примером

Тогда сделайте иначе. Прескалер и ARR не трогайте, пусть таймер молотит постоянно по полному кругу, а интервал засекайте модулем сравнения:
;
Прерывание, соответственно, ловите от модуля сравнения.

У таймеров есть режимы предварительной записи,

// TIM2->CR1 |= TIM_CR1_ARPE;//Включен режим предварительной записи
//регистра автоперезагрузки
// TIM2->CCMR1 |= TIM_CCMR1_OC2PE;//Включен режим предварительной
//загрузки регистра сравнения

так вот выключите предварительную запись.