Тоже интересовался такой задачей, правда до реализации дело не дошло, осталось в теории.
Через FTDI не получится, они собой представляют DEVICE устройства,
а нужно реализовать HOST.
Что-то типа
этого. Или
этого.
Готовых проектов не встречал, правда уже года 1,5 не интересовался.
Задача на самом деле не такая простая, как кажется.
Примеров реализации FAT много в и-нете есть. А софт для HOSTA зависит от выбранной микросхемы.