Есть такое понятие в авторском праве, как "
Программа для ЭВМ". Но в данном случае вопрос несколько философский. В принципе, компилируется через ЭВМ. Значит, вроде бы подходит. А результат уже - конфигурация ПЛИС, можно сказать топология ИС в какой-то степени. Топология так же защищается. Но о ней, конечно, речи не идет. С этим более чётко.
И всё-таки, по-моему, это однозначно программа для ЭВМ (определение достаточно широко). Можно выполнить поиск по базе ФИПС на предмет VHDL, если кто-то уже регистрировал.
P. S. Затраты разовые, за регистрацию. Размеры всех пошлин можно найти на том же сайте ФИПС (или Роспатента...?).