Защита конфигурационных бит

Доступ к конфигурационным битам блокируется, если микроконтроллер перешел в режим программирования и изменение их значений не даст никакого эффекта до тех пор, пока микроконтроллер не выйдет из режима программирования. ... Доступ к конфигурационным битам также блокируется при подаче питания в нормальном режиме работы (не программировании).

Так собственно в каком режиме тогда писать фьюзы, и как???

Попробуйте найти и разобрать оргинальный текст приведенной цитаты.
Смысл такой -- изменения в установке фьюзов не будут приняты "к сведению" и не повлияют на функционирование микроконтроллера до завершения режима программирования/прошивки.

В выбранном режиме -- Serial Downloading, по описанному в документации протоколу.
Успехов!

spi_send_byte(0xAC);//1
spi_send_byte(0xA0);//2
spi_send_byte(0x00);//3 - не важно
spi_send_byte(0x3F);//4 Запись конфигурационных бит


spi_send_byte(0xAC);//1
spi_send_byte(0xA8);//2
spi_send_byte(0x00);//3 - не важно
spi_send_byte(0xC1);//4 Запись старших конфигурационных бит


spi_send_byte(0xAC);//1
spi_send_byte(0xA4);//2
spi_send_byte(0x00);//3 - не важно
spi_send_byte(0xFE);//4 Запись расширенных конфигурационных бит

Программатор собран, прошивка заливается, читается, читаются фьюзы, сигнатуры и т.д.