Микроконтроллер ATMEGA128A, отправляет серию команд с заданным интервалом, для чего использую таймер 1, режим - сброс при совпадении. Прерыванием не пользуюсь. Просто опрашиваю флаг OCF1A в TIFR. Сбрасываю его программно командой TIFR&=~(1<<OCF1A); Не сбрасывается!
И что существенно, программу я пишу не с нуля, а перевожу старый полностью рабочий проект с ассемблера на си.
В старой программе было:

Это работает.
В новой программе:

Это почему то не работает!

Alternatively, OCF1A can be cleared by writing a logic one to its bit location

Правильно, все флаги (другого не помню) сбрасываются записью единицы в этот разряд.



А как у Вас работало в старой программе? В программе команда "cbr r16,OCF1A" записана неверно. Должно быть "cbr r16,(1<<OCF1A)" . Команда CBR делает сброс разрядов регистров в соотвестствии с маской, т.е. если в Вашем случае OCF1A это 6-й разряд (к примеру, не смотрел для Вашего МК), то маска будет выглядеть как 0b00000110 и сброс будет произведен для 1-го и 2-го разряда, а Ваш 6-й останется несброшенным. К тому же флаги брасываются установкой единицы. Сбрасывать прямым сбросом не пробовал. Зачем отступать от Datasheet?
Может в первой редакции программы все удачно сложилось и Вы не заметили неточности при написании программы?

Во-первых, как уже написали, этот флаг сбрасывается записью в него единицы (читайте документацию). Во-вторых, запись TIFR |= 1<<OCF1A; тоже будет неправильной, потому что будет сбрасывать все выставленные флаги в этом регистре. Правильной будет запись TIFR = 1<<OCF1A. Насчет спользования инструкции SBI в этом случае не помню, делает ли она чтение-модификацию-запись или нет - надо читать документацию.

Ну да, теперь выяснил. Прогнал в отладчике. OCF1A это разряд 4. Ассемблерная инструкция "cbr r16,OCF1A" транслируется в команду "andi r16,0xFB". Нужный бит, OCF1A остается = 1 и сбрасывается (а с ним и не нужные биты тоже).
Выходит, бывает полезно переводить на другой язык - вылазят малозаметные ошибки.



Ну на си это уже и не актуально - компилятор сам решит какой инструкцией пользоваться.