Здравствуйте!
Необходимо работать с nand flash памятью, подключенной к fpga, из NIOS. может кто то подскажет где взять контроллер/драйвер?

Что за флеш? Есть поддержка ONFI? В любом случае придётся писать/покупать. Альтера не предоставляет это ip. Хардверное ip от cadence входит в состав hps в soc cyclone v/arria v. Для nios аналогов не знаю.

Флеш Samsung K9MCG08U5M, плис Cyclone 3

Ни о чём не говорит
Я имею в виду, какой у ней интерфейс. Вам нужно посмотреть NAND Flash interface на предмет чего-то вроде ONFI 1.0 compliant. Если да, то это стандартное решение, но ip придётся поискать (есть какой-то проект на open cores, но не знаю на какой он стадии готовности и насколько он вообще работоспособен), вероятнее всего покупать. Писать свой ONFI совместимый контроллер - не сильно тривиальная задача. Кстати на форуме кажется этой весной была тема про это.

На самом деле, сложность IMHO не в самом контроллере (интерфейс там как раз относительно не сложный), а в организации wear leveling.