Окно - это обычный фильтр.
Окно - это не фильтр. Фильтрация - это линейная, независящая от задержки операция, а умножение на окно хотя и линейно, но зависит от задержки сигнала. Аналогично переносу частоты, при умножении на окно в спектре сигнала могут появляться новые спектральные компоненты (чего никогда не бывает при фильтрации) - в частотной области происходит свертка ПФ сигнала и ПФ окна. Простой пример - окно представляющее собой один период комплексной экспоненты, сдвинет спектр сигнала на один колодец преобразования Фурье.