Библиотеки создаю Schematic library. При переносе на флешке на другой РС они теряются. Как их закрепить в проекте независимо от РС при этом в ходе работы есть необходимость их корректировать.

DXP/Preference/ Data management
укажите путь, или проинсталлируйте ваши библиотеки.
А еще лучше -- на всех компах используйте одинаковую конфигурацию всех настроек.