Имеются вот такие аккумуляторы. Планирую заряжать по 2 штуки последовательно с помощью MCP73844. Разрываюсь между двумя вариантами:

1. Взять MCP73844-8.4V и заряжать до полного напряжения. Но учитывая что защита по описанию вырубает аккумулятор при 4.2 вольтах, плюс отсутствие балансировки, плюс погрешность этой самой защиты... Есть предположение, что защиту будет постоянно вырубать, что плохо скажется на сроке службы да и вообще все это дело может криво заряжаться.

2. Взять MCP73844-8.2V и заряжать НЕ до полного напряжения. Эти зарядники предназначены для Li-Ion coke anode на 4.1V. Но вопрос, нормально ли будут чувствовать себя при такой зарядке мои аккумуляторы?

Без балансировки нельзя, не важно: заряжать до полного напряжения или нет. Ничего не мешает одной банке зарядиться до 4.3В, а другой до 3.8 - в результате потенциальный пожар.
Некоторые производители готовые сборки, например 2LIR18650-PCB-LD. Там внутри защита и подобранные по параметрам ячейки.

До 4.3 помешает зарядиться защита, она разорвет цепь и зарядка дальше не пойдет, а ток заряда будет не больше 200мА, так что до пожара не дойдет. Другой вопрос, что при этом вторая банка зарядиться меньше чем нужно, но я думаю проверять вначале, если слишком сильный разбаланс, то в пару не пойдет.

Точно, батарейки с защитой, досмотрел лот до конца.
Тогда другой минус: если будет перекос и сработает защита - то батарейки не буду работать, пока их не отсоединить физически от схемы заряда и потребителей.
Так работает схема защиты у АКБ от EEMB, с которыми приходилось работать.

Встроенную защиту лучше не использовать. Это защита от пожара. Надо контролировать напряжение каждой банки и в случае разбаланса - проводить самостоятельно балансировку. Например выводить из цепи заряда - аккумулятор.

Defin, Зарядка сама отключится если ток упадет. А что касается нагрузки, если верить даташиту DW01-P, то блокировка снимается если подключить нагрузку.
Atridies, так она и не будет использоваться. Я думаю, что если взять зарядник на 8.2 вольта, то до ее срабатывания не будет доходить.