Пишу и отлаживаю в Eclipse(Ubuntu). Ранее OpenOCD запускал из терминала. Теперь сделал запускалку в External Tool Configuration. Все работает. Но не приложу ума как перезапустить OpenOCD в случае необходимости

Предположение:
killall openocd, и запустить снова?

Гран мерси! оно самое.

Тогда можно в скрипт запуска openocd добавить killall, тогда запуск и перезапуск будут по одной команде.

Именно так я и поступил. Очень удобно. Спасибо, Антоха.