Подскажите как лечить проблемку. Собираю проект, заливаю нормально работает. Вношу изменения и перезаливаю все в норме. Непонятно по какой причине при очередной заливке в Eclipce вылетает ошибка Problem Occurred 'Launching name_configuration' has encontered a problem. Download ELF Process failed. и больше проект не отрабатывает. Перезаливка *.sof, Generate BSP, создание новой RUN Configurations... не помогают. Что делать?

С FTDI еще что-нибудь подключено?

В debug configuration -> Target connection проверьте system ID и system timestamp.

Да, плохая ошибка, которая постоянно вылетает.
В буржуйнете я даже видел совет переустановить все средства разработки альтеры
Но, для себя я вычислил, что не может залить, когда косяк с avalon шиной данных. Проверьте что все шины подключены к мастеру CPU.
Ну и проверьте, если есть "торчащие" ноги в FPGA - там они не болтаются в воздухе?