Нашёл вот такую ссылку: https://www.altera.com/support/support-reso...1312014_45.html
Как я понял там говорится, что если VCCIO = 1,8В и VCCPD = 2,5В, а также имеются LVDS входы или выходы, то ножка на 1,8В в этом банке может использоваться только как вход.
Так ли это?

Надо понимать, что как выход тоже можно использовать, но выходное напряжение будет 1,8 В. Я например, на многие микросхемы, питаемых от 3,3 В подаю на их вход 2,5 В т.к. у них VIH=2,0V.

А какой ещё может быть выход если VCCIO = 1.8В
Смущает, что написано, что при VCCIO = 1,8В, VCCPD = 2,5В и использовании LVDS - пин в том же банке может использоваться только как вход. Или я что-то не так понимаю?

Мне кажется вы неправильно понимаете. Я не вижу того что вы утверждаете. Ну попробуйте в Quartuse назначить пин на выход в том же банке где используете LVDS. У меня Quartus не ругается.

У меня тоже не ругается. Но как же тогда ссылка в первом сообщении? Там же сказано, что VCCIO должно быть 2.5В для использования ножки как вход/выход, если меньше то только вход.

Попытаюсь сказать в последний раз и более уже не буду участвовать. Банк поддерживает LVDS только если VCCIO(V)=2.5. Для других напряжений VCCIO поддержка LVDS не возможна. При любых разрешенных VCCIO пины могут работать как входы и выходы с соответствующими диапазонами входных напряжений и выходным равным VCCIO для не диф. сигналов. VCCPD выбирается только в зависимости от напряжения VCCIO.