Взялся вплотную с Ц4. Стал отлаживать и, при программировании, возник косяк. Программатор доходит, примерно, до 75% и вываливает ошибку. Причём, может случиться и на 70% и на 80%.
Бластер, самопал, прекрасно работает с Ц2. Т.е. вопрос такой, у кого-нить самоделка работает с Ц4? Чтобы понимать, где собака порылась.

Quartus какой версии ?

У меня 9 не хотел прошивать FLASH. Поставил Prime и все заработало.

11.1
Кстати, такая идея мне, чего-то, не пришла в голову. Спасибо.

Была похожая проблема, не хотел шить (не самоделка) и вис на разных этапах. Решилась беда припаиванием конденсатора небольшой емкости (примерно 50 пик) параллельно резистору на входе nCE.

nCE тут не при чём. Он, жосска на земле. Оказалось, он, таки, программирует. Просто зависает программатор Квартуса. Помогает расцепиться, только пеедёргивание бластера. И индиктор программатора сразу показывает 100% удачную загрузку. А прошивка живёт, мотает ногами ,как положено. Даже передёргивание бластера не влияет. Блин... Интересно, в железе(бластер) или в Квартусе косячина?

по моим ощущениям от сборок разными квартусами: 4-е семейство циклон/стратикс начинает +- хорошо поддерживаться в 12.1 и наиболее полно в 13.1, а в 14.0 и далее их начали потихоньку ломать.