На одном разъёме присутствуют +12, +24, +5 вольт питания.
Исходя из ДШ на REF195 КЗ между +12 и +5 а так же GND и +5 не фатальны.
А как защитить выход опорного +5в от замыкания с +24?
Чтобы не страдала точность и стабильность опорного напряжения.

сделать его на разъеме с другой стороны от GND?

Как ни располагай контакты, замыкание это не исключает 100%. А дураки очень непредсказуемы, замкнут незамыкаемое в два счёта Проще говоря, нужно сделать вход +5 устойчивым к подаче на него +24.

Тогда защитный диод (снаббер) вольт на 6 + предохранитель.
И еще подать питание 12В через диод.
В ДШ не написано, но судя по схеме, в этом случае не должно ничего сгореть при кратковременной подаче на выход вольт 6-7.

Допустимо ли в качестве предохранителя применить РТС? На какой ток его рассчитывать?

Что такое РТС?
Почему бы не просто самовостанавливающийся предохранитель?
А какие у Вас токи, никто кроме Вас не знает.