Доброго дня!
Что-то ум за разум зашёл.

Когда-то делал плату с программированием Альтеровской конф. микросхемы EPC2 по JTAG, там я к общему проводу привязывал TCK, а к питанию подтягивал TDI, TMS и TDO. Все резисторы 1К, всё работало.

В Альтеровских описаниях привязаны только TCK, TDI и TMS.
Надо вообще TDO к чему-нибудь привязывать, или, если он выход, может и голым его оставить можно?
Кабель - БайтБластер2.

А вы гляньте схему альтеровскую для своего чипа. В основном нет, там прямой выход.
По крайней мере на моих двух платах так.

А в БайтБластере эта цепь к чему-нибудь привязана?
Она же там входная.

Подтяжка выходной цепи на работоспособность влиять не должна (особенно в случае push-pull). ИМХО это может влиять только на диагностику при неисправности цепи TDO.

PS: и не заблуждайте людей - самоваров давно уже не делают, а вот пряниками на Октябрьской пахнет - это дааааа)

Разве? Я думал Штамп их ещё клепает.

ЗЫ.
Ну, более-менее ясно, тему закрою.