Цитата
Вопрос - как аттестовать эту самую проверяющую программу?

- А потом аттестовать программу, которая будет аттестовать эту самую проверяющую программу..
Как человек, полностью прошедший этап сертификации измерительной системы в Реестре средств измерений, может и смогу помочь. После ответов на следующие вопросы:
1) Назначение прибора (метод измерения, методика выполнения измерения, алгоритмы обработки - все авторское?)
2) Количество измеряемых величин (это чтобы отнести к средству измерения или к системе измерения).
3) Сложность мат. обработки (есть ли необходимость оценивать алгоритмические погрешности).
4) По метрологической аттестации (эталон, интерфейс с ПЭВМ)
Совсем по существу - вычисляйте погрешности МА в Excel (кто же Вас заставит электронные таблицы аттестовать, это же "ручной" аналог методики)
Первый список литературы (завтра смогу расширить)
1) Грановский В.А., Сирая Т.Н. Методы обработки экспериментальных данных при измерениях. – Л.: Энергоатомиздат, 1990.- 288 с. (книга довольно основопологающая

)
2) МИ 2174-91. ГСИ. Аттестация алгоритмов и программ обработки данных при измерениях. Основные положения (об погрешностях алгоритмов)
3) ГОСТ 8.009-84. ГСИ. Нормирование и использование метрологических характеристик средств измерений. НТД (всем известный ГОСТ)
4) МИ 2438-97. ГСИ. Системы измерительные. Метрологическое обеспечение. Основные положения (заменен на ГОСТ, найду ...)
5) МИ 2439-97. ГСИ. Метрологические характеристики измерительных систем. Номенклатура. Принципы регламентации определения и контроля.
6) МИ 2440-97 «ГСИ. Методы экспериментального определения и контроля характеристик, погрешности измерительных каналов измерительных систем и измерительных комплексов». (несколько своеобразный)
7) МИ 2377-96 «ГСИ. Разработка и аттестация методик выполнения измерений». (если используется уникально сложная методика)
8) ПР 50.2.006-94 «ГСИ. Порядок проведения поверки средств измерений».
Это не все ... Могу также поделиться некоторыми методиками поверки и МА по конкретным приборам, разработанным в ОАО "СНХА".