Добрый день!
Существует ли алгоритм выделения с data stream >> clk?
И самое интересное можна ли его реализовать в цыфровом виде(в FPGA)?

Есть такие микросхемы clock recovery - выделяют clk из потока данных и делают retiming данных к выделенному clk. Как пример могу предложить посмотреть AD800, AD802 от Analog Devices.

В связи (в том числе в сотовой) давно широко используется код Манчестера, на приемной стороне без проблем выделяется парой-тройкой D-триггеров, на передающей - еще проще: Clk XOR Data

В точку! Спасибо!