Здравствуйте! А вот кто подскажет, зачем я задаю некоторые соединения как дифф. пары, если авто-роутер потом роутит их как попало? Это можно как-нибудь лечить, или уже клиника?

видимо только ручками в "аля" интерактивном режиме.

кто-нибудь добился большего?

В AD6 подобная проблема была обнаружена при интерактивной трассировке. Та цепь, которую непосредственно ведешь мышкой, идет в текущем слое, а ее пара - в механическим или в маске. После танцев с бубном пришли к выводу, что причина в файле, созданном в более ранней версии, так как в примере из AD6 все трассировалось как надо. ИМХО пока что гораздо проще посчитать параметры в Si9000 от Polar Instruments и водить эти цепи ручками, задав предварительно правила.