Цитата
А что такое режим JIC?
JTAG Indirect Configuration File.
A binary file (with the extension .jic) containing EPCS1, EPCS4, EPCS16 and EPCS64 serial configuration device data and the serial flash loader device name.
You can use a JIC File to program the configuration data for either a Cyclone, Cyclone II, or Stratix II device into an EPCS1, EPCS4, EPCS16 or EPCS64 serial configuration device. To do so, use the Cyclone, Cyclone II, or Stratix II device as a bridge between the Programmer or external controller and the configuration device.
You can create JIC Files with the Convert Programming Files command (File menu).
Цитата
Сброс платы это общий RESET или что-то другое?
Да. Сброс компонент на плате + старт конфигурации.
Цитата
Начали мигать все светодиоды с частотой, где-то на глаз, 2 герца
Это factory config так себя ведет.
Рядом с остальными с.д. есть маркировка о причине ошибки.
Установите NIOSII EDS, там есть вся необходимая документация и исходники.