Значит, имеем девайс, корпус которого заземлен. Входной канал - АЦП с МК - отвязаны через изол. DC/DC и ADuM. Периодически, при "горячем" подключении длинных линий происходит подвисание МК. От статики - искру слышно... Как лучше защититься от этого? Склоняюсь в сторону печатных разрядников непосредственно у вх. клемм сразу чтобы на землю уходило... Тем более под газовые места нет совсем... Вот только стабильность параметров (сопр. изоляции и напр. пробоя) настораживает...

включить резисторы по входам длинных линий.

Рекомендую прочитать FAQ с САХАРы по соответствующей теме (http://www.caxapa.ru/sch/).

Вот в этом топике обсуждали проблему защелкивания ADuMов от статики.

Резисторы (и не только: TVS еще, потом диодная защита) по входным линиям стоят. Сбоит именно МК - точно известно. Хотя у него по линиям тоже 100Ом-ные резисторы. Разряд по земле изолированной части схемы пролазит через емкость, которой шунтирован DC-DC конвертор на землю прибора...

проверьте насколько хорошо заземлен корпус прибора (сопротивление и индуктивность провода заземления) и для таких условий по-моему желательно все выводы МК подключать через резисторы в непосредственной близости от МК.

А вы не шунтируйте DC-DC в цифровую землю.
Вы с обоих входов поставьте конденсаторы (2,2нФ 3-5кВ) на заземление (но не на цифровую землю). Между входами такую же ёмкость.
Цифровую землю и заземление можно соединить, но только в одной точке, которую надо тоже выбрать с умом.