Не переопределяется функция irq_handler в CrossWorks, точнее будет сказать из этого файла не видится другая функция с таким именем. тест примерно такой:
...
ldr pc, [pc, #irq_handler_address - . - 8]
...
irq_handler_address:
.word irq_handler

irq_handler:
b irq_handler

.weak irq_handler

в другом файле:
void irq_handler(void) __attribute__ ((interrupt ("IRQ")));
void irq_handler(void)
{
...
}

что бы могло быть???

Попробуй в ассемблерном тексте написать так:

.extern __irq_handler
или
.word __irq_handler

пробовал, не видит из асембленого файла идентификатор __irq_handler, собственно в этом то и проблема, если бы видел внешний идентификатор, то и irq_handler бы переопределился.

сейчас выяснил, что если файл в котором описана ф-ия irq_handler компилировать как си, то всё нормально, а если как с++, то внешняя ф-ия irq_handler не видится. не понятно почему?

У меня твой пример корректно компилируется. Тебе следует поставить патч на компилятор.
Посмотри обсуждение некорректной обработки прерывания IRQ в присоединённом документе.

http://electronix.ru/forum/lofiversion/index.php/t21799.html

extern "C" попробуй для irq_handler-а.

Для С и С++ используются разные способы превращения имен функций и переменных из исходного текста в ассемблерный текст. Для С это превращение как-то прогнозируемо (т.е. добавляется _ в начале имени или совсем не изменяется), а для С++ полный бардак.

Да, спасибо, extern "C" помогло.