Собрал блок управления реле на ПЛИС EPM7032 но при подаче 220 V на контакты реле переодически пропадают сигналы с ПЛИС на транзисторные ключи управляющие релюхами?

Классика...
http://www.caxapa.ru/faq/emc_immunity.html

Когда-то нас донимали соседи-радиолюбители: как только они включали свои коротковолновые шарманки - у нас не работали осциллографы и другая аппаратура, часто сбоила и цифровая. Мы собрали простейший мультивибратор на реле (12 вольт) и включали его одновременно с ними. Никто ничего делать о области радиоэлектроники в радиусе 200 метров вокруг нас не мог. Они вынужденно отключались, мы тоже отключали свою штучку и продожали спокойно работать.
Не сочтите зо оффтоп. Так, иллюстрация к проблеме.

Управлять ПЛИСкой или микроконтроллером напрямую силовой схемой однозначно не стоит, тем более если коммутируется 220В. Необходимо как минимум защитить цифровые порты управления внешними импульсными диодами (на + питания и GND), а еще лучше применить гальваническую развязку через оптроны. Иначе можно получить не только ложное срабатывание портов, но и выжечь эти порты. Проверено практикой, реализовывал ШИМ контроллер на MCS51. Ну и правильная разводка печатной платы не на последнем месте.

Кажется тебе придется переделывать печатную плату. Лучше сделай это после того как прочитаешь и поймешь все что найдешь на тему помехоустойчивости, ЕМС и т.д. А то как бы не пришлось переделывать еще несколько раз.

Абсолютно уверены, что не привысили допустимый выходной ток вывода ПЛИС, когда подсоединяли транзисторный ключ? Управлял прямо с плисины(MAX3128A), без развязки релюхой, которая в свою очередь коммутировала электромагнитный пускатель, совершенно без проблем. ИМХО в данном случае опторазвязка не нужна. Если бы вместо релюхи был бы силовой ключ, MOSFET, IGBT, тогда-да, но в данном случае достаточно поставить транзисторные ключи, и незабыть зашунтировать обмотки диодиками, чтоб защитить схему от выбрасов обратной ЭДС, во время переключения реле.

Насколько я помню глобальные сигналы CLK, RESET, OE физически представляют из себя аллюминиевую сетку, которая "собирает" на себя все помехи по эфиру. В данном случае замыкания контактов реле (особенно сильноточных) вызывает приличный электормагнитный импульс, который "пролетает" в эту самую сетку. Это вызывает переброс триггеров в обратные состояния, импульсы на выходах обычной логики и т.д.
Я задавал вопрос представителям Альтеры, что они думают по этому поводу и предполагают ли принимать меры к дополнительной защите этой самой "сетки". Они ответили, что это сложно технологически и приведёт к значительному увеличению себестоимости микросхем. Поэтому вводить дополнительные меры защиты не планируют.
Дело в том, что мы тоже сталкнулись с подобной проблемой в одном из своих устройств. Вопрос был решён просто - грамотной переразводкой платы. ПЛИС подальше от реле + заземляющий контур вокгуг реле (как и советовали технари из Альтеры). Устройство прекрасно работает и неплохо продаётся.
Конечно самый простой (но значительно более дорогой) способ выхода из положения - применение оптосимисторов. С ними подобная головная боль пропадает автоматически.