В проекте имеется ряд компонентов с разными конактными площадками, общим для которых является одинаковый диаметр сверла. В Drill Chart я вижу, например, следующее:
Diam
0.599
0.6
0.799
0.8

При этом в менеджере билиотек в свойстах контактных площадок указано везде 0.6 и 0.8, соответственно, а в проекте платы происходит вышеописанное.

Никак не могу понять отчего так происходит.
Единицы измерения везде - мм.

Возможно, вы указали диаметр в мм, а footprint потом сохранили в дюймовой библиотеке. OrCAD сделал пересчёт, отсюда и погрешность в последнем знаке.

Точно, причина именно в этом. Жмете шифт -Т, затем ищете данный диаметр и правите его в таблице. Вопрос в три минуты поисков и работы, так что я обычно от этого не страдаю.

Не всегда помогает правка в таблице (вводишь 0.6 - а получаешь все равно 0.599). Проблема может заключаться еще и в слишком маленьком значении "Display resolution" настройки "System setting". Попробуйте увеличить его (до значения минимального разрешения ваших диаметров).
Какая здесь связь я не понимаю, но именно данная операция несколько раз и помогала.