Читаю доку.
...
If no valid ARM vector sequence is found, the boot Uploader is started. It initializes the Debug
Unit serial port (DBGU) and the USB Device Port. It then waits for any transaction and downloads
a piece of code into the internal SRAM via a Device Firmware Upgrade (DFU) protocol for
USB and XMODEM protocol for the DBGU.
...

Как шить через DBGU, понятно. А вот как через DFU? Что для этого надо? Где взять софт..

См. прилагаемый файлик.
Откуда брал - не помню - просьба не пинать ногами. Может у кого есть официальный линк...

Спс..
А файл-то уже 6 раз скачали.. Никто не отвечал, но всем нужно? %)

Интересная прога. JTAG, USB, COM.. Только все-равно плата не детектится виндой. Вроде, нет одного pull-up резистора..

Включение - без излишеств... как в стандартном at91rm9200dk_design_files.zip (на атмеловском сайте находится с полпинка)
Детектится по ресету платы.

Файлик можно найти на сайте www.at91.com поиском по ключевому слову "uploader" или "dfu" - выдается всего одна ссылка: по ней данный файл и исходники pc_application.exe на 4 МБ.