В PLace Pins, пины нумеруются без префиксов. Перенумеровывать построчно в ручную как то не серьезно. Может как то можно выбрать тип нумерации, задать пропущеные литеры?

Воспользуйтесь для генерации БГА корпусов программой LP Libraries - никаких проблем, все делается за пару минут. Ссылку поищите на форуме.

LP Libraries это утилита expedition? Искал ссылку по сайту, не нашел. Стоит вопрос о переходе с пикада, выбор альтиум или експедишин. Пока ментор поинтересней, но нужно как то обосновать это.
Скажем, ну нет сервиса нумерации BGA, не понятно с присваиванием имени слоям печатной платы. А если дальше наберется еще десяток... Может трассировка по лучше... только начал разбираться с пакетом.

1. Шаблоны размещения пинов используют номера пинов из таблицы. Соответственно номера нужно перенумеровать - для этого есть специальная команда, но последовательная автоперенумерация получится только в пределах одного ряда (или столбца). Перенумеровать можете как внутри таблицы, так и в графике (мышкой проведя по пинам).
2. Чтобы не заниматься нумерованием каждый раз, можно например создать одну большую BGA с нумерацией и на основе ее уже создавать другие (удаляя не нужные пины - если в диалоге Properties для CELL изменить кол-во пинов, то пины со старшими номерами автоматически исчезнут из CELL - см. пример применения подобной возможности в http://megratec.ru/data/ftp/exp_movie/sot_223.rar).
3. Можете не создавать CELL сами, а скачать готовые ЦБ со всеми корпусами Xilinx (или Altera) http://www.mentor.com/products/pcb/expedit..._kits/index.cfm (самый большой BGA на 1760 пинов - думаю пока вам большее кол-во пинов не понадобится ). Кстати на сайтах многих производителей выложены библиотеки с применяемыми ими корпусами (например http://www.analog.com/en/DCDesignToolsDisp...1,,00.html#951)

Спасибо! Библиотека корпусов - как раз то что нужно.