Подскажите как расчитывают дросель, например управляю двигателем с помощью МК а дросель который стоит то трещит то свистит.

Посмотрите в книге "Дроссели переменного тока радиоэлектронной аппаратуры" Бамдас А.М., Савиновский Ю.А. - М.: Сов. радио, 1969г. - 248с. Изложена теория работы нелинейного дросселя и методика проектирования оптимальных дросселей переменного тока.

Ссылка: http://boroda3.nm.ru/dptra.djvu, там ещё есть книги на подобную тематику.

Вообще неплохо привести схему включения и тип двигателя. Двигатель постоянного тока? Включен как нагрузка Step-Down конвертера? Собственно расчет такой-же как и в источниках питания. А свистеть он все равно будет, если частота ШИМ лежит в звуковом диапазоне. Громкость свиста обратно пропорциональна качеству намотки дросселя