Подскажите, можно ли в Матлабе (FDATool) собрать фильтр выполняющий адаптивное выравнивание сигнала. Если можно , то какой тип фильтра нужно использовать.

Посмотри help по матлабу, там есть функции адаптивных фильтров (названия не помню). можешь использовать линейные фильтры с коррекцией коэффициентов по методу наименьших квадратов LMS

Да , но как эти фукции использовать в FDATool , что бы сгенирить на автомате VHDL код