Нужно отладить поддержку аппаратуры, работающей в прерывании таймера. Вложенные прерывания разрешены. В результате - останов то происходит, только значения переменных в окне View значения переменных, которые должны измениться, не меняются от останова к останову. По шагам пройти невозможно. Запретить вложенные прерывания тоже не могу.
Раньше мирился с тем, что отладка MSP430 при работе прерываний весьма затруднительна, но тут очень желательно иметь эту возможность.
Может, есть какие-то секреты, которые я не знаю?

А если по старинке, не делать никаких остановов, а в самом прерывании копировать нужные переменные в другое место, а уж оттуда выводить их на индикацию, в последовательный порт....
можно и из самого прерывания, если это не нарушит алгоритм работы.