Имею эволюху на Stratix-е. Собрал ядрышко с NIOS II / e и таковой частотой 100MHz. Скомпилировал, Classic Timing Analyzer всем доволен, кроме десятка каких-то Assignment-ов, которые проигнорировал. Не смог найти, где же они прописаны, чтобы удалить. Но это полбеды. Создал свой компонентик, без HDL-файлов, просто "вывернул" avalon-шину наружу из ядра. Снаружи просто защёлкиваю шинные сигнальчики в тригерочки, и вот тут Classic Timing Analyzer "заплакал" и стал меня пугать, что выше 60МГц частоту задирать не стоит в такой системе. Очень уж настораживает "округлость" величины 60МГц. Может просто где-то ещё есть Assignment-ы не проигнорированные, и стоит мне только их поменть на 100МГц и наступит мне счастье? Знатоки Nios-а откликнитесь пожалуйста!!!

работает на 75 Мгц - полёт нормальный, несмотря на то что у меня аналайзер ругается на то что не соблюдается времянка - заргузка в регистры переферии(собственный компонент)
на 100 не пробовал за ненадобностью.
забыл сказать циклон 1

Без вашего модуля же все работает на 100мгц, значитон не может работать на тактовой выше 60мгц.
Посмотрите таймквестом что именно не может выше 60 работать.