Вопрос такой:
Как сделать в плате отверстие под элемент?

Ответ такой же, как вопрос: Что по-вашему есть "отверстие в плате под элемент"? Некое отверстие, куда элемент должен помещаться целиком, не задевая плату?
Если вам лень подумать минуту и сформулировать вопрос так, чтобы было понятно не только вам - всем остальным будет лень думать за вас и еще и отвечать на то, что придумали.
Телепатов на форуме и так хронически не хватает, а сейчас еще и лето...

Попробуйте использовать сверлильный станок

ответ от телепата:
если вырезать, а не просверлить
в drw слое, на плате, просто нарисовать нужную фигуру, и обозначить - "вырезать". Так же как и фрезу ..
А если просверлить - поставить "лишний" пад .. - можно просто на плату, а можно и в компонент ..

спасибо!!