Сделали ошибку, приборы попали в Америку и должны быть перепрограммированы на месте.
Прибор имеет только JTAG, с попутной лошадью могу передать только OLIMEX JTAG ICE.
Может, существуют программы попроще, чем AVR studio. Фузы без изменения, нужно изменить только программную память.

Берем файл jtagice.exe из студии. Запускаем его с ключём -? и там всё расписано. Затем пишем батник и вперёд!

Спасибо, получилось. Осталось научить находить установившийся ком-порт и редактировать батник.
Странно, там две DLLки в АВР студио в этой паке, но они не нужны.