Нужно отлаживать устройство с ATMega2560/ATMega1280.
Какие есть отладочные средства (не обязательно производства Atmel) для этих контроллеров, аналогичные по функциям JTAGICEII, но более дешёвые...

Дополнение.
Также интересует есть ли какие-нибудь готовые отладочные платы с установленной ATMega2560 и макетным полем?

AvrStudio + AvrDragon.

Dragon не поддерживает отладку кристалов больше 32k

Вообще при некоторых действиях дракон начинает более лояльно относится к юзеру в плане ограничений. Но это чистой воды шаманство. По нормальному - альтернатива второму айсу только отладка через командную строку.

В своё время очень болезненно отнеслись к покупке ICE2. Время которое сэкономил данный девайс и, соответственно, сумму денег оценить сейчас не представляется возможным. Время отладки сокращено в разы. Если он сейчас выйдет из строя, то я не жалея и не задумываясь тут же куплю другой.

Покупать какую-то макетную плату, STK или делать это самому - не вижу необходимости. Всё прекрасно отлаживается непосредственно на живом изделии.

Я не говорю что ICE2 - идеальный. У меня есть претензии к нему, но пока альтернативы не вижу.

В "ЭФО" СПб до конца августа акция от ATMEL, STK500 + ICEII по 150$, вполне разумная цена. Правда срок поставки 6-8 недель.