Имеется система на базе АЦП, перед ацп стоят фильтры и ИУ (на входы ИУ подаются сигналы с датчиков), поскольку система должна быть предельно точной(мерить напряжение с разрешением до 5мкВ) и использоваться не только в лаборатории, то пришла в голову такая мысль: поставить аналоговые ключи на входе ИУ, которые будут переключать входы ИУ между "землей" и выходами аналогового датчика. Во время калибровки ключи переключаются на "землю", берется парочка замеров с АЦП- вычисляются коэффициенты, чтобы убрать смещение- далее ключи переключаются в нормальный режим, коммутируя входы ИУ и выходы датчика.

Есть в этой идее рациональное зерно, или подобный подход только испортит/усложнит все?

Есть. Примерно так калибруются тракты почти во всех современных измерительных приборах. И естественно, что это не только повышает точностные характеристики, но и усложняет схему.
При желании, конечно, можно и испортить, если неграмотно посчитать алгоритм и цепи калибровки.

Так можно не только дрейф нуля устранять но и дрейф Ку ИУ - подключая образцовый источник.
Есть один ньанс с МОП-ключами, в момент переключения инжектируется заряд (осцилограф показывает пик). Это почти не лечится - в теории конечно возможно аппаратно устранить, но проще производить замеры после паузы для "успокоения" показаний УИ.

Да, конечно, задержка будет производится перед вычислением калибровочных коэффициентов. А все-таки что лучше: подключать образцовый источник или "землю" т.е нуль?

гы, и то и то по очереди

И то и другое (в идеале). Тогда получится самокалибрующаяся система. А так достаточно нуля

При закорачивании входов (а у ИУ они ведь они дифференциальные, так?) можно компенсировать смещение нуля в тракте и его дрейф. Если имеем образцовый источник с хорошими характеристиками, то ещё и дреф Ку. Современные АЦП (дельта-сигма и девайсы на их основе) имеют внутренние средства для обоих видов калибровки. Вот для примера выдержка из DS на AD7738:
Нажмите для просмотра прикрепленного файла

Спасибо, я именно на примере Дельта-Сигма АЦП и подумал: не сделать ли подобную вещь для всей аналоговой части.

Идея правильная, но желательно в цепях калибровки учесть полное смещение тракта и хорошенько усреднить.
Процедуру калиброки можно запускать раз в минуту или еще реже. Каждый раз ее делать не надо.

Начет закорачивания выводов. Я не уверен, но наверное стоит закорачивать на эквивалентное сопротивление датчика, если датчики высокоомные. А то вы не скомпенсируете токи смещения ИУ. Тут все нужно правильно рассчитать. Для компенсации коэффициэнта усиления ИУ для данной температуры желательно подключать ещё опорное напряжение, близкое к максимуму диапазона. Так вы скомпенсируете и сдвиг и наклон. Опять же все зависит от требований по точности.

Сопротивление выходов датчика меньше 1 ома, так что с этим проблем нет. Другое дело, что сам провод, который будет соединять систему и датчик, штука непростая, но с этим справимся.