Глупый вопрос: как организовать функцию которая возвращала бы массив?

Возвращай Указатель на массив, хотя массивы и есть указатели.

Дело в том что насколько я понимаю при выходе из процедуры регистры очищаются. Или я не прав?

если чочешь что бы функция модифицировала массив, тогда передовай в функцию указатель на массив:

void func(char *s, char *r, int f)
{
while(f)
{
*r=*s;
f--;
s++;
r++;
}
}