Рабочая программа записана во флэш, микроконтроллеры проверены и отложены. Лежали без питания в пластмассовой коробочке пол-года. При подключении выяснилось, что в LPC935 программа вообще исчезла из флэш, а в LPC936 сохранилась частично. Работали только несколько функций. Я думаю, после записи нельзя, чтобы микроконтроллер не работал, нужно, чтобы питание было подано постоянно. Скорее всего, причина исчезновения программы: отсутствие питания. Есть ли у кого опыт?

Ваще то это нонсенс. Обычно прога либо виснет, либо глючит с некоторым определенным уровнем.
ИМХО: дело не во флеше а в контексте состояния этих контроллеров. Я имею ввиду, что коробочка то не назамог же была заперта