Как добиваются точного позиционирования при монтаже SMD варианта PLS разъема ? Или есть более подходящие штырьковые коннекторы для такого монтажа?

Для автомата или при ручном монтаже?
При автоматическом монтаже за точность установки SMDкомпонент отвечает установщик. Или его точности Вам недостаточно?
При ручой (мелкосерийной) сборке используют всякие хитрости, вроде оправок, шаблонов и пр. Ну и правильная конструкция площадок для монтажа так же весьма полезна.
Если надо запаять штуки две-пять разьемов, паяйте по ответной части.

Не понял вопроса . Извиняюсь.
Чем Вам планарніе PLSки не подходят?

Есть, но не дешовые.

http://www.hirose.co.jp/cataloge_hp/e54300012.pdf
(With Boss)

Еще есть штыри с направляющими (with Peg).
http://www.molex.com/pdm_docs/sd/015912080_sd.pdf

Однорядных таких не встречал, а вот двухрядных на Digikey.com много, особенно двухмиллиметровых.

Пасибки. Вопрос с позиционированием урегулировали вчера с закащегом. Поскольку надо соединять 2 платы всего тремя проводочками и позиционирование самих плат уже обеспечено, то решили разъемы не ставить, а соединять пайкой проводками без изоляции. Но вообще ваши ссылки пригодятся, поскольку автоматических установщиков разъемов лично я не встечал.

Вопрос не в установщике, а в компонентах, которые должны быть приспособлены для монтажа автоматом.
Пот например эскизик вида той же самой PLS-ки для монтажа:

P.S. Большой такой "набалдашник" посредине разьема после монтажа снимается.

А набалдашники эти что вручную ставить? Или разъем уже продается с ним?

Я о чем то похожем и думал, когда спрашивал, только у меня была мысль о пластковых штырьках, торчащих из коннектора и эти штырьки вставлять в отверстия в плате перед пайкой.

Именно так дело и обстоит.
За этот самый "набалдашник", рассположенный, как правило, в центре масс компонента, установщик и хватает оного при установке.

Не совсем по теме, но новую не хочется открывать. Как можно запаять в печке разъемы, паяемые в отверстия? Вот думаю в трафарете сделать специальные окна, закрывающие сквозные отверстия платы и наоборот открывающие контактные площадки. Устанавливать естественно вручную, на клей. Просто "волны" все равно нет и паять разъемы вручную не хочется. Надо ли как-то по особому делать сами контактные площадки, есть подобный опыт?

Может не совсем по вопросу (в печках не паял) - но попробуй сравнить температуру в печке и температуру плавления пластмассы корпуса разъёма....
Может выдержит, а может и нет....

SMD разъемы как правило потому и подороже штыревых, что пластмасса в них термостойкая. Просто подуйте феном (200-300гр.) на разъем и он потечет (или по крайней мере оплавится). Теперь подумайте что станет с ними в печке.
Вторая проблема, трафарет используют для нанесения пасты, паяют уже без трафарета, расплавленный припой может весь стечь из отверстий. Если разъем сверху, то просто плохо запаяется, а если снизу (судя по клею так и есть), то высока вероятность замыканий в полости разъема (пластик никогда не прилегает плотно к плате).
Но все же оборудование для автоматизированной пайки не поверхностных компонентов у контрактников есть. Это автоматы индивидуальной пайки в азотной среде (подробнее не раскажу, у нас такого нет).