Вопрос такой - насколько я понимаю, Flash, SRAM, SDRAM (не DDR) можно подключать к любым выводам ПЛИС (cycloneII), даже разбросав по разным банкам. Нет ли здесь каких либо подводных камней, можно ли подключить эти вещи так, как это удобно печатникам?

C Flash и SRAM - вряд ли, а SDRAM я бы промоделировал, если она на предельных (100-133) частотах будет работать.

на мой взгляд для шинных сигналов типа данных и адреса может появится проблема с data-skew при разбросе вектора по разным банкам