Жалко тратить место на плате под стандартный JTAG. Нужен на всякий случай для отладки. Так-что идеальный вариант чтоб его не было, но когда понадобится появился. Может есть предложения?

А стандартный это какой? Я всегда на плате ставлю только переходные отверстия (если возможно то рядом) - в случае необходимости подпаиваюсь.