Почитал не мало тем и решил остановится на атмега128 хотелось бы изучить и понять все нюансы МК, но кроме переведенного с английского даташит ни чего не нашел, а хотелось бы найти весь список регистров и по понятней статьи где описывается прерывание, порты и ацп.

Помогите чем можете.

По-моему в даташите лучше всего это и расписано...
Можно почитать еще это:
Евстифеев. Микроконтроллеры AVR семейства Mega.2007.

На мой взгляд, если у Вас нет опыта, то из одного даташита конечно трудно что-то извлечь. Про механизм прерываний, про порты ввода-вывода, АЦП и про другие ньюансы можно почитать не привязываясь к конкретному МК. Поможет в этом www.google.com.
Если будут конкретные вопросы, можно воспользоваться поиском по форуму либо задать собственный вопрос, если поиск ничего не дал.
А вообще не все там уж и сложно!
Успехов и терпения!