Здраствуйте! Подскажите, пожалуйста, в какой среде и как правильно прописывать AT команды при написании программ для мк AVR. (Описание АТ команд для модема есть.) Большое спасибо.

В той же, где и до этого писали программы для avr.
WinAVR, IAR, CodeVision...

Не совсем корректный вопрос.
Для AT команд необходимо использовать UART, подключенный к соответствующему GMS модулю или телефону.

А вот для UART софт писать можно как на C так и на ASM.
Правда работа с AT командами c помощью ASM представляет из себя жуткий геморрой.

Спасибо за хорошие ответы. Подскажите мне, пожалуйста, где взять какой-то справочник для СodeVisionAVR (WinAPI или СИ), в котором описаны АТ команды или есть фрагменты программы с описанием открытия сеанса обмена даными через UART и другие (используется модем телефона Siemens C55).

В справочнике к компилятору в принципе не должно быть описано АТ команд. В том же CodeVision есть Wizard, который вым позволит создать шаблон программы для работы с UART.

Спасибо Юрий! Но может есть хотя бы клас СИ для организации обмена данными с модемом через UART???

Классы - это уже из области C++, а вы вроде бы сначала говорили про ассемблер
Попробуйте поискать чьи-нибудь библиотеки для работы с модемом.

Вот, почитайте для начала:
AVR323: Interfacing GSM modems
Здесь исходники

Может слегка прояснится направление движения..