Подскажите пожалуйста, есть такая возможность программирования ARMa. И если есть то как грамотней сделать.

Возможность есть. Достаточно сделать bootloader с поддержкой Ethernet'а. Принципиально ничем не отличается от такого же с USB/UART.

Для начала изучить протоколы. За тем определиться, через какой транспорт загружать обновления. затем написать сам бут

Тут в соседней ветке обсуждался u-boot на LPC, возможно, стоит копнуть в эту сторону.
http://electronix.ru/forum/index.php?showtopic=49693

http://www.denx.de/wiki/UBoot/SourceCode

Uboot, мягко говоря, тяжеловат для загрузки в флешовый SAM. Даже за основу я бы не советовал его брать.