Проц: AT91SAM7A3. J-Link-ARM ver.5.4 Написал простенькую прогу:запускаю ШИМ, в обработчике прерывания ШИМ дергаю допольнительным выводом(типа контролирую, что вошел в прерывание). Проблема: при обычной работе проца - все ок, на осциле вижу ШИМ и вижу как дергается вывод. Запускаю в режиме отладки под IAR 5.11, запускаю прогу(F5): вижу как работает ШИМ, но дополнительный вывод не меняет своего состояни. В чем проблема, подскажите.

А регистры ШИМ'а в каком-нибудь watch'е не открыты?

Никаких окон watch,просмотра памяти, регистров не открыто. Открыто окно листинга программы и ассемблера. Все остальное закрыто.

А попробуйте сбросить контроллер прерываний (AIC_EOICR = 0) после его настройки или в скрипте отладчика после сброса. Похоже, это прерывание остается необслуженным когда вы подаете отладчиком ресет, соответственно процессор не вызывает прерывания с таким и более низким приоритетом.

Действительно, сбросил контроллер и все заработало. Спасибо за совет.