На 9263EK есть резисторы R96-R99, которые находятся между самим ЦПУ и разъемом. Вопрос: где эти резисторы должны располагаться - ближе к процу или разъему? В описании процессора написали, что эти резисторы должны быть и картинка есть, но рекомендаций по размещению не дают. А вопрос возник, потому что на моей плате (аналог платы от Атмела) есть артефакты с USBH.

Раз задаете такой вопрос, вероятно, Вы развели плату с длинными связями по USB? Уточните длины проводников, вероятно проблема в ином

Для одного порта длины проводников: 186 и 185.4 мм.
Для второго: 164.3 и 161 мм.

Разводил Спектрой с правилами для диф-пар. Может дело в разъемах усбишных? Не бывает специальных разъемов с интегрированными резисторами, дросселями и прочим, как для Езернета?