Микроконтроллер должен получать сигналы с отдаленных концевых выключателей. Предельная частота срабатывания 1Гц. Я думаю поставить после концевика фильтр низких частот и оптрон. Ваше мнение? Какой оптрон выбрать?

Если концевик - действительно механический выключатель, то оптрон крайне невыгоден, разве что есть большая вероятность попадания в цепь концевика сети. Но тогда нужно делать полноценную гальваническую развязку и ставить еще развязанный источник питания для концевика. Оптрон для нее подойдет любой транзисторный, самый дешевый.
Если концевик - источник напряжения, тогда выбор оптрона определяется допустимым током этого источника. Если можно отнять миллиампер 10 - то как в предыдущем случае, иначе - нужно искать слаботочный с большим коэффициентом передачи по току.

Фильтр не нужен. Дребезг срабатывания можно (и нужно) программно устранять. Оптрон желателен, т.к. заранее неизвестно, что там на конце длинной линии приключиться может. Да и сигнал в линии будет токовый (для диода оптрона) что по помехозащищенности всяко лучше потенциального.
Минус один - для запитки концевика нужен будет отдельный гальванически изолированный от МК источник питания.
Если у МК входы без гистерезиса, то оптрон лучше брать сразу со встроенным триггером Шмитта, типа H11L1.

Посмотрите MAX6816/6817/6818 - обработка сигналов от концевиков с коммутацией на землю.
Подавление от дребезга, защита от статики ±15 кВ и перенапряжения на линии до ±25 В. Выход ТТЛ.
Кроме конденсатора по питанию больше никакой обвязки не требуется, т.е. на вход - кнопку, выход - напрямую на контроллер.
Если нет ограничений по цене (стоит, зараза, от 60 р.) - самое оно.