Например между аналогом и цифрой
Задал clas to class clearence в Design Rules PCAD
После разводки для текущего слоя все выполняется, а для многослойной платы проводники идут друг над другом в соседних слоях, в результате появились наводки.
Может надо задать какие-то аттрибуты, или это все правильно перенести в DO-файл?

Попробуйте устоновить параметры tandem_noise в .DO file до route.
Должно сработать.

Попробую, но хотелось бы чтонибудь типа более детерменированное
Типа расстояние между цепями не ближе X мм для слоев Y и Z.
Как он будет считать Noise непонятно. Величина наведенного шума будет зависить от крутизны цифровых сигналов, распределенного входного сопротивления для аналоговых входов, от наличия между ними слоя земли - все это правильно задать проблематично. А если например трасса пройдет под SMD элементом то наведеннуа помеха вообще не будет учитываться.

Да, Вы првы но я другого спосба не знаю.
Может кто-то другой подскажет.
Мне тоже интересно.