Подскажите, пожалуйста, как в КД записать внешние слои МПП: медная фольга,а какая? Марка? Толщину мы пока выбрали 35 мкм.

Просто укажите, что "базовая толщина фольги 35 мкм".
Марку указывать не надо: выбор поставщика фольги - это дело завода-производителя.

Имейте в виду, что итоговая толщина меди после металлизации составит от 50 до 70 мкм.

Если речь идет про подготовку КД не для производителя,
а для ваших служб (нормоконтроля, приемки и т.д.),
то давайте поступим так: отправьте вопрос в более четкой формулировке
на адрес pcb@pcbtech.ru, и мы в понедельник дадим вам пример того.
как описать этот материал в документации.