Повесил на Ain0 и Ain1 резисторный делитель. Написал програмку вот кусочек:

unsigned char comp_ctr=0;
// Analog Comparator interrupt service routine
interrupt [ANA_COMP] void ana_comp_isr(void)
{
comp_ctr++;
ACSR &=~(1<<3); отключение компаратора
PORTD.3 = 1; включение светодиода
delay_ms(50); пауза
PORTD.3 = 0; выключение светодиода
ACSR |=(1<<3); включение компаратора
}

Кручу резистор все прекрасно работает, при переходах из 0 в 1 и наоборот светодиод мигает.
Вопрос- а чем отслеживать в каком состоянии выход компаратора?
Что бы в программе выполнять действия в зависимости от того на какой ноге напряжение выше.

Use ACO bit, Luke!
А вообще неплохо бы контроллер и компилятор указывать

Мега88 и CodeVizionAVR.
За ответ спасибо все понял. Точнее подсказали.
Вот так правильно?

#define ACO 5
#define COMPARE_RESULT ACSR&(1<<ACO)
...
if (COMPARE_RESULT) {bla-bla-bla();};

чуть надёжнее: