Изучаю самопрограммирование AVR МК. Прошил контроллер программой загрузчиком. Прошил с его помощью свою программу, попытался стерерть не получается флеш остается такой же. Lock биты не запрограммированы. Подскажите, пожалуйста, что не так?

Надо полагать, что ошибка в bootloader'е. Внимательно прочитайте последовательность действий при стирании страницы флеш-памяти.
На форуме есть примеры загрузчиков. Посмотрите, сравните, поправьте и на круге 10-том все получится!)
У меня, например, работает!) Посмотреть код не могу. Я дома. Код на работе.

Может ссылку подскажите на рабочую программу. Отлаживал свою программу в AVR Studio - все работает!

Последний раз, когда кто-то здесь воевал с самопрограммированием, причина была, как я помню, в ошибке при загрузке RAMPZ. Может быть, опять те же грабли ? Да, и правильно задан размер boot-секции, команда spm точно внутри ее ? Очередность записи в SPMCSR и команды spm, выполнение spm не позднее четырех тактов после записи ?