Возникла проблема при печати из PCAD2001 на широкоформатном матричном принтере, схема как-то растягивается, хотя при печати той же схемы на струйном принтере всё нормально.

Посмотри, может стоит галочка на Fitpage. Соответственно если принтер широкоформатный изображение будет растягиваться

PCAD 200x при выводе на матричник как-то оригинально масштабирует. Тестовый квадрат 50х50 мм вывелся как прямоугольник 50х42 мм. Может он как-то привязывает разрешение экрана? В любом случае, вывести квадрат как квадрат мне пока не удалось.

этой проблеме лет наверное 5 или больше..
Pcad неправильно масштабирует при выводе на принтеры с несимметричным разрешением, например на ВСЕ! матричные 9-ти игольчатые. На 24 -х игольчатых - нормально.

можете поставить эксперимент со струйником, поставив ему разрешение, например, 360х180 или 720х360, и вместо квадрата 50х50 получите "квадрат" 50х100 или 100х50....

Стандартнми способами (настройками) - решения нет.
Меняйте оборудование....

Попробуй сначала печатаь на виртуальный принтер ( в PDF или FinePrint)
а дальше уже на матричный