Есть 2 проблемы:
1) Встроенная статическая память запитана от внешней батарейки (39 pin), на этой цепи сидит фильтровой конденсатор,
при снятии питания и последующей его подачи статическая память засоряется. Вопрос почему ?

2) Как без внешней синхронизации можно уменьшить уход значения времени встроенного в него RTC ?

А какой величины уход RTC у вас? И за какой период?
У меня в системе вот у же более полугода подобный процессор очень точно тикает. Уход - не более 10 сек.

В день уход = 10 сек ?
У Вас нет таблицы корректировки времени для RTC STR912 ??.

///////
1) Встроенная статическая память запитана от внешней батарейки (39 pin), на этой цепи сидит фильтровой конденсатор,
при снятии питания и последующей его подачи статическая память засоряется.
////////

C таким не сталкивались ??????

Возможно, с просадкой напряжения батарейки при снятии-отсутствии-подаче основного питания. Для проверки параллельно батарейки подключить конденсатор большой емкости - от 1000uF и обязательно рассмотреть процессы подачи-снятия основного питания на медленной развертке цифровым осциллографом.

Не за день, а за полгода, наблюдаю пока испытания и доработки ведутся.